La risposta è: sì!
http://www.alitalia.com/IT_IT/MM/Retrocredito.aspxRichiesta miglia
Le miglia sui voli Alitalia vengono generalmente accreditate in maniera automatica, se hai volato con un biglietto elettronico in circa 2 giorni. Se riscontri tuttavia che alcune miglia non ti sono state accreditate, puoi effettuare la tua richiesta online.
Prima di compilare il seguente modulo, ti suggeriamo comunque di affettuare un'ultima verifica sul tuo estratto conto.
Come usare il servizio
Puoi richiedere online i voli (tratte) effettuati da almeno 7 giorni e non precedenti ai 4 mesi rispetto alla data odierna;
Puoi richiedere online solo voli Alitalia con biglietto elettronico;
Per voli effettuati da altre compagnie Partner o con biglietti cartacei, consulta la procedura per la richiesta di accredito miglia;
Inserisci il numero del biglietto.
Fonte:
http://www.alitalia.com/it_itPer il secondo punto: se l'hai indicata al momento della prenotazione credo di no... ma... alla fine, portarsi una tessera non occupa molto spazio!

Ma se la dimentichi, puoi sempre comunicare il numero al check-in (che puoi memorizzare sul cellulare). Peraltro ti può tornare comodo se trovi troppa coda e fai il self check-in con le macchinette.