Alloggio: non so dirti dei nomi, come zona l'ideale e' vicino a una metro. Zone carine sono San Giovanni o San Paolo (beh carino e' tanto per dire, ma almeno non sei a troppa distanza).
Se vuoi evitare del tutto i mezzi, le cose piu' importanti da vedere sono tra Colosseo, piazza Venezia, piazza del Popolo e San Pietro: dal Colosseo a San Pietro a piedi e' una sfacchinata, ma se ti piazzi nel mezzo puoi pensare di arrivare dappertutto senza mezzi. Un giorno vai verso destra e uno verso sinistra
Evita la zona Termini soprattutto ai lati e "dietro" la stazione (piazza Vittorio Emanuele), la Chinatown di Roma. Ok invece verso piazza della Repubblica, via Cavour, via Nazionale...
L'on the road e' carino, ma quanti giorni avete? Roma ti porta via almeno 3 giorni solo per vedere le attrazioni principali. Poi ci sono i "dintorni", che pero' si fanno anche coi mezzi. Posti meno turistici cosa intendi? Trattorie tipiche ci sono anche in centro, basta sapere dove andare.
Ostia si raggiunge tranquillamente col trenino dalla stazione Ostiense-Piramide, ma se volete andare in spiaggia lasciate perdere, se invece puntate alle rovine di Ostia Antica, ve le consiglio assolutamente! Sembra Pompei ma meno conosciuta (e con pochi affreschi questo si'). Ostia Antica e' una fermata a se' del suddetto treno. Il treno potete prenderlo facilmente anche dalla stazione San Paolo della metro, sono i binari accanto. L'escursione porta via almeno mezza giornata.
Poi vi consiglio Tivoli, che si raggiunge col bus (40 minuti almeno) dalla metro Rebibbia mi pare. Ci sono la villa di Adriano (l'imperatore... ) e poi Villa d'Este, di tutt'altra epoca ma molto bella. Per Tivoli calcola l'intera giornata.